Lista kursów

English version

Kod kursu: BIS20082f15
Rok / Semestr: 2015/2016 letni
Nazwa: Filogenetyka molekularna
Kierunek: Bioinformatyka
Typ studiów: II st. - magisterskie
Rodzaj kursu: Fakultatywny
Semestr studiow: 2
Punkty ECTS: 2
Formy kształcenia (wykłady / ćwiczenia / inne): 15 / 15 / 20
Prowadzący: dr Tomasz Strzała
Język: polski
The course taught in English if the group has ≥6 students. The course taught in Polish with a possibility of support in English if the group has <6 students

Efekty kształcenia: Wiedza - posiada wiedzę teoretyczną na temat procesów ewolucyjnych w biologii oraz taksonomii ewolucyjnej [BI2_W08_TP]; - analizuje drzewa filogenetyczne, rozumie modele i algorytmy służące do ich konstrukcji [BI2_W08_TP]; - rozumie różnicę w klasycznym I molekularnym podejściu do filogenezy [BI2_W08_TP]. Umiejętności - potrafi przygotować zestaw danych do analizy filogenetycznej [BI2_U03, BI2_U04, BI2_U05, BI2_U08_TP, BI2_U11_BP]; - umie przeprowadzić analizę filogenetyczną skutkującą utworzeniem drzewa kilkoma metodami oraz poprawnie zinterpretować uzyskane wyniki [BI2_U03, BI2_U04, BI2_U05, BI2_U08_TP, BI2_U11_BP]; - weryfikuje uzyskane w postaci drzewa wyniki potrafiąc przetestować istotność uzyskanej topologii oraz oszacować dystanse genetyczne pomiędzy kladami na drzewie [BI2_U03, BI2_U04, BI2_U05, BI2_U08_TP, BI2_U11_BP].

Kompetencje:

Wymagania wstępne:

Treści kształcenia: Koncepcje ewolucji i klasyfikacji organizmów, metody rekonstrukcji drzew filogenetycznych, weryfikacja i interpretacja wyników analiz filogenetycznych.

Literatura: 1. Futuyma, Douglas Ewolucja, Un-t, 2009 2. Higgs P. Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN Warszawa 2008 3. Baxevanis A.D. Bioinformatyka PWN Warszawa 2004

Metody oceny: Zaliczenie ćwiczeń: Obecność na ćwiczeniach jest obowiązkowa; student może mieć tylko jedną nieusprawiedliwioną nieobecność. W przypadku nieobecności usprawiedliwionej student jest zobowiązany do zaliczenia odpowiedniej części materiału. Zaliczenie przedmiotu: studentów obowiązuje zaliczenie przedmiotu polegające na wykonaniu projektu zawierającego w sobie elementy zrealizowane podczas ćwiczeń oraz wymagającego zinterpretowania uzyskanych wyników i wysnucia na ich podstawie wniosków.

Uwagi: