Lista kursów

English version

Kod kursu: BIS10054f17
Rok / Semestr: 2017/2018 letni
Nazwa: Modele Liniowe i Mieszane na Przykładzie Analizy Danych Biologicznych
Kierunek: Bioinformatyka
Typ studiów: I st. - licencjackie
Rodzaj kursu: Fakultatywny
Semestr studiow: 6
Punkty ECTS: 2
Formy kształcenia (wykłady / ćwiczenia / inne): 15 / 15 / 0
Prowadzący: dr inż. Tomasz Suchocki
Język: polski


Efekty kształcenia: Wiedza: Student w czasie kursu zapoznawany jest z teoretycznymi i praktycznymi aspektami modelowania danych biologicznych i bioinformatycznych przy pomocy modeli liniowych i mieszanych [BI_W9]. Szczególny nacisk kładziony jest na poznanie metod statystycznych oraz umiejętność zastosowania tych metod do danych rzeczywistych w pakiecie komputerowym R [BI_W13, BI_W14, BI_W15]. Umiejętności: Student zna wyposażenie laboratorium komputerowego oraz specyfikę i zasady bezpiecznej pracy w laboratorium komputerowym, -ma opanowane podstawowe wiadomości dotyczące statystycznego modelowania danych bioinformatycznych oraz obsługi pakietu statystycznego R [BI_U01, BI_U03, BI_U07]. Przeprowadza analizy statystyczne na danych rzeczywistych [BI_U03, BI_U04, BI_U05, Kmopetencje społeczne (postawy): Student wykazuje zrozumienie analizowanych zjawisk biologicznych i bioinformatycznych, -ma świadomość odpowiedzialności za wspólnie realizowane w zespole zadania [BI_K02, BI_K07], -wykazuje odpowiedzialność za powierzony sprzęt, -rozumie ważność przestrzegania zasad BHP w laboratorium komputerowym [BI_K07]. BI_U07, BI_U12].

Kompetencje:

Wymagania wstępne: pakiety statystyczne, statystyka matematyczna, matematyka

Treści kształcenia: Wprowadzenie do pakietu R, modele liniowe, analiza wariancji, kryteria AIC, BIC i mBIC, regresja krokowa, modele mieszane, testowanie istotności estymowanych parametrów, test LRT, estymacja parametrów wariancji w modelach mieszanych.

Literatura: 1. Biecek P. (2011). Analiza danych z programem R. Modele liniowe z efektami stałymi, losowymi i mieszanymi, Wydawnictwo Naukowe PWN. 2. Biecek P. (2008). Przewodnik po pakiecie R. Oficyna Wydawnicza GiS. 3. Crawley M. J. (2007). The R Book. Wiley.

Metody oceny: Metody oceny Zaliczenie przedmiotu: na podstawie oceny z ćwiczeń. Metody oceny ćwiczeń Zaliczenie ćwiczeń: systematyczne (3 razy w semestrze) pisemne sprawdziany na ocenę. Obecność na ćwiczeniach jest obowiązkowa; student może mieć tylko jedną nieusprawiedliwioną nieobecność. W przypadku nieobecności usprawiedliwionej student jest zobowiązany do zaliczenia odpowiedniej części materiału. Zaliczenie ćwiczeń na podstawie średniej ocen.

Uwagi: