Lista kursów

English version

Kod kursu: BBS10143f11
Rok / Semestr: 2011/2012 zimowy
Nazwa: Analiza asocjacyjna
Kierunek: Biologia
Typ studiów: I st. - licencjackie
Rodzaj kursu: Fakultatywny
Semestr studiow: 5
Punkty ECTS: 3
Formy kształcenia (wykłady / ćwiczenia / inne): 15 / 30 / 0
Prowadzący: dr hab. prof. nadzw. Joanna Szyda
Język: polski


Efekty kształcenia: Student zdobywa teoretyczną wiedzę dotyczącą genetycznych i biometrycznych podstaw prowadzenia analizy asocjacyjnej – wykrywania powiązań pomiędzy obserwowaną zmiennością fenotypową osobników, a zmiennością genetyczną. Ponadto, w oparciu rzeczywisty zbiór danych, student uczy się przeprowadzania takiej analizy przy użyciu programów komputerowych oraz interpretacji uzyskanych wyników.

Kompetencje: Ukończenie kursu pozwala na samodzielny wybór metodyki i przeprowadzenie analizy statystycznej danych uzyskanych w wyniku zastosowania nowoczesnych technik biologii molekularnej stosowanych na szeroką skalę w genetyce zwierząt gospodarskich, jak również u człowieka, takich jak: markery SNP, mikromacierze, Sekwencjonowanie DNA. Studenci nabędą również umiejętność pracy z dużymi zbiorami danych.

Wymagania wstępne: biometria, genetyka ogólna, matematyka

Treści kształcenia: Sprzężenie, asocjacja, równowaga Hardyego Weinberga, analiza asocjacyjna, wykrywanie genów.

Literatura: Andrew R. Collins (2007) Linkage Disequilibrium and Association Mapping: Analysis and Applications (Methods in Molecular Biology), Humana Press; Krystyna Charon, Marek Świtoński (2006) Genetyka ogólna. PWN; opis programu PLINK http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/plink/

Metody oceny: Zaliczenie ćwiczeń na podstawie średniej z ocen zdobywanych w ciągu semestru: kolokwia, projekty grupowe; zasób wiedzy do zaliczenia przedmiotu: 70%.

Uwagi: