Lista kursów

English version

Kod kursu: BBS20176o12
Rok / Semestr: 2012/2013 zimowy
Nazwa: Bioinformatyka
Kierunek: Biologia
Typ studiów: II st. - magisterskie
Rodzaj kursu: Obligatoryjny
Semestr studiow: 1
Punkty ECTS: 4
Formy kształcenia (wykłady / ćwiczenia / inne): 15 / 15 / 0
Prowadzący: dr hab. Joanna Szyda
Język: polski / angielski


Efekty kształcenia: Wiedza: Student: W1 - posiada wiedzę pozwalającą na interpretowanie zjawisk i procesów przyrodniczych w pracy badawczej i działaniach praktycznych [KB2_W01]; W2 - zna metodologię badań obowiązującą w naukach przyrodniczych [KB2_W01]; W3 - formułuje hipotezy badawcze oraz rozwiązuje podstawowe problemy naukowe [KB2_W01]; W4 - wie jak stworzyć interesującą prezentację multimedialną [KB2_W01]; W5 - opisuje i wyjaśnia zjawiska biologiczne w kategoriach matematycznych [KB2_W02]; W6 - rozumie znaczenie metod statystyki opisowej i matematycznej w modelowaniu, opisie i interpretacji zjawisk i procesów biologicznych, opracowaniu statystycznym danych oraz w pozyskiwaniu i przetwarzaniu informacji [KB2_W02]; W7 - zna najważniejsze narzędzia statystyczne umożliwiające ocenę przebiegu zjawisk i procesów przyrodniczych [KB2_W02]; W8 - przeprowadza analizę wariancji przy użyciu pakietów statystycznych [KB2_W02]; Wskazuje przydatność testów parametrycznych i nieparametrycznych [KB2_W02]. Umiejętności: Student: U1 - potrafi tworzyć bazy danych. Do analizy danych, opisu zjawisk i testowania hipotez stosuje właściwe metody statystyki elementarnej i matematycznej oraz sprawnie wykonuje obliczenia, także przy wykorzystaniu pakietów statystycznych. [KB2_U03]; U2 - na podstawie analizy zebranych danych formułuje i interpretuje wyniki wykonywanych zadań badawczych. Umiejętnie zestawia je w tabelach i ilustruje graficznie. Porównuje z innymi źródłami. Wyciąga odpowiednie wnioski i formułuje odpowiednie sądy. [KB2_U04]; U3 - wykazuje umiejętności krytycznej analizy i selekcji informacji, zwłaszcza ze źródeł elektronicznych. Tworzy i korzysta z baz danych bioinformatycznych. Ocenia powiązania pomiędzy genami. Prowadzi analizy genomu (analiza sprzężeń, analiza asocjacyjna). Wykorzystuje algorytmy stosowane w bioinformatyce. [KB2_U04_BT];

Kompetencje: Kompetencje społeczne (postawy): K1 - jest chętny do systematycznej aktualizacji wiedzy z zakresu biologii i dyscyplin pokrewnych i świadomy potrzeby uczenia się przez całe życie [KB2_K01]; K2 - jest aktywny w podnoszeniu swoich kwalifikacji na drodze kursów i szkoleń specjalistycznych a także studiowania specjalistycznego piśmiennictwa [KB2_K01]; K3 - potrafi inspirować i organizować proces uczenia się innych osób [KB2_K01].

Wymagania wstępne: brak

Treści kształcenia: Bazy danych, równowaga Hardyego-Weinberga, współczynnik rekombinacji, analiza sprzężeń, analiza asocjacyjna, symulacje Monte Carlo, łańcuchy Markova, metody klasyfikacyjne

Literatura: 1. Barnes, M.R. (2007) Bioinformatics for Geneticists: A Bioinformatics Primer for the Analysis of Genetic Data. Wiley; 2. Higgs, P.G., Attwood, T.K. (2008) Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN

Metody oceny: Zaliczenie ćwiczeń: Na podstawie średniej ocen z przygotowywanego przez studentów projektu, dwóch sprawdzianów pisemnych oraz prezentacji. Na ewentualne podwyższenie oceny ma wpływ aktywny udział studenta w ćwiczeniach. Obecność na ćwiczeniach jest obowiązkowa; student może mieć tylko jedną nieusprawiedliwioną nieobecność. Zaliczenie przedmiotu: studentów posiadających zaliczenie ćwiczeń obowiązuje pisemny lub ustny egzamin (5-10 otwartych pytań) w sesji egzaminacyjnej. Egzamin pisemny trwa ma

Uwagi: specjalność: Techniki Laboratoryjne w Biologii